Dans le cadre de l'infrastructure de recherche nationale France Life Imaging, le GIN (Grenoble Institut des neurosciences) recrute un ingénieur spécialisé en bases de données et services orientés web avec expérience. Il aura pour mission de définir un modèle conceptuel des données et métadonnées d’imagerie utilisées en imagerie du petit animal dans différents centres d’imagerie en France.

 

Contexte :
France Life Imaging (FLI) est une infrastructure de recherche nationale visant à établir un réseau coordonné et harmonisé pour l'imagerie biomédicale en France. Ce projet a été récemment sélectionné à l’appel à projet des investissements d’Avenir « Infrastructure en Biologie et Santé ». Sa mission est (1) de coordonner à l’échelle nationale les activités de recherche en imagerie in vivo et d’unir les compétences pour repousser les barrières technologiques actuelles, et (2) de fournir aux scientifiques un accès commode à un éventail complet de technologies d'imagerie (150 systèmes d'imagerie) et de services intégrés et harmonisés. En outre, l'infrastructure sera ouverte à des collaborations avec des partenaires industriels.

 

Dans le cadre de cette infrastructure, le noeud “Image Analysis and Management” (IAM) est coordonné par Inria (http://www.inria.fr). L’objectif de ce noeud est la mise en place d’une infrastructure logicielle et matérielle pour la gestion des données d’imagerie médicale (homme et petit animal) en provenance de différents centres de recherche clinique. La solution développée permettra de rendre interopérable différents sites distribués de production de données et de méta-données hétérogènes via l’utilisation de modèles sémantiques et d’ontologies. L’objectif principal du noeud IAM sera de mettre en place une infrastructure versatile à partir de composants logiciels fournis par les partenaires académiques du projet et permettant la connexion de composants allant de la gestion des données et des méta-données d’imagerie au traitement des images produites à travers des outils mis a disposition sur le poste de travail de l’usager ou à travers l’usage de ressources de calcul massives (grilles de calcul, clusters, …). Cette tâche de développement et de déploiement est planifiée sur une durée de 3 ans avec un effort de 372 hommes/mois d’ingénierie.

 

Description de l’activité :
Sous la direction du chef de projet technique il s’agira :
- De définir un modèle conceptuel des données et métadonnées d’imagerie utilisées en imagerie du petit animal dans différents centres d’imagerie en France
- De rédiger les spécifications techniques d’un tel modèle
- D’étudier les extensions nécessaires au modèle de données existant de gestion des données d’imagerie humaine sur la plate-forme SHANOIR
- Implémenter ces extensions
- Définir en interaction avec les utilisateurs finaux l’interface homme machine pour faciliter le peuplement de la base
- Implémenter cette interface

 

Connaissances requises :
- Formation de haut niveau en informatique (Ingénieur université ou grande école) spécialisé en base de données et services orientés web
- Expérience de 2-3 ans minimum dans le développement de base de données
- Très bonne connaissances des langages: JAVA, SQL, XML et des outils de développement associés
- Très bonne connaissances des frameworks de Java Enterprise (JEE): Java Server Faces (JSF, p. ex. JBoss Richfaces), JBoss Seam, Hibernate/JPA
- Maîtrise de l’administration de base de données
- Expérience Linux et Windows
- Excellentes capacités relationnelles et rédactionnelles
- Rigueur, autonomie et curiosité technique pour s’impliquer dans un projet multidisciplinaire et multiéquipes
- Bonnes capacités pour communiquer en anglais
- Une connaissance du domaine de l’imagerie médicale et du traitement d’image sera un plus

 

Le poste offrira :
- L’opportunité de travailler dans un environnement convivial et riche en échange avec des équipes leaders dans leur domaine de recherche en imagerie médicale, traitement d’images et gestion des informations d’imagerie en mode distribué et hétérogène
- L’opportunité de travailler dans un environnement interdisciplinaire, à l’interface entre le monde de la santé, la radiologie et l’informatique
- L’opportunité de travailler dans un environnement couplant des objectifs technologiques innovants et des objectifs opérationnels motivants

 

Pour être éligible, le dossier de candidature devra comporter :
- Un CV complet intégrant l’expérience du candidat ainsi que ses formations académiques
- Lettres de recommandation de personnes pouvant apporter leur soutien au candidat
- Une lettre de motivation pour le poste détaillée et personnalisée

 

Localisation : GIN U836 Grenoble (http://neurosciences.ujf-grenoble.fr)
Date de prise de fonction : dès que possible
Durée : 24 mois avec extension de 12 mois
Salaire : à partir de 2000€ par mois (nets) en fonction de l’expérience du candidat

 

Merci d’envoyer vos candidatures à: Cette adresse e-mail est protégée contre les robots spammeurs. Vous devez activer le JavaScript pour la visualiser.
Veuillez mentionner le code du poste “WG3_GIN” dans l'objet de l’e-mail de candidature.

 

Contacts Scientifiques :
Cette adresse e-mail est protégée contre les robots spammeurs. Vous devez activer le JavaScript pour la visualiser., GIN Inserm, Grenoble (+33 (0) 4 56 52 06 01)
Cette adresse e-mail est protégée contre les robots spammeurs. Vous devez activer le JavaScript pour la visualiser., ICube, Strasbourg (+33 (0) 3 68 85 44 87)